A Mongol és Belső-ázsiai Tanszék csaknem háromnegyed évszázados története elválaszthatatlanul kapcsolódik össze a huszadik századi magyar altajisztikai és mongolisztikai és tibetisztikai kutatásokkal éppúgy, mint a magyar őstörténeti, nyelvi és kultúrtörténeti kutatások főáramával. A jelenleg folyó kutatások fő irányvonalai a következők: mongol nyelvjáráskutatás, a mongol népek hagyományos nomád műveltsége, a mongol sámánizmus, buddhizmus és népvallás kutatása, történeti források feldolgozása.